2
استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران
10.22124/japb.2024.28614.1554
چکیده
ویروس سندروم لکه سفید (WSSV) عامل بیماری لکه سفید (WSD) میباشد که طی دههای اخیر موجب ضررهای اقتصادی زیادی در صنعت جهانی پرورش میگو شده است. هدف از این تحقیق، شناسایی مسیرهای زیستی موثر و ژنهای کلیدی مرتبط با بیماری لکه سفید در میگوی سفید غربی (Litopenaeus vannamei) بود. دادههای ریزآرایه شامل 6 نمونه از بافت هپاتوپانکراس میگوهای سالم و 6 نمونه از بافت هپاتوپانکراس میگوهای آلوده به WSSV از پایگاه داده GEO با شماره دسترسی GSE4955 استخراج و با استفاده از ابزار GEO2R آنالیز شدند. سپس ژنهای افتراقی با بیان معنیدار مشخص شدند. از نرمافزار آنلاین STRING به منظور ساخت شبکه بین ژنهای افتراقی استفاده شد. سپس ژنهای کلیدی با استفاده از افزونه CytoHubba در نرمافزار Cytoscape و با روش حداکثر مرکزیت دسته (MCC) شناسایی شدند. عملکرد پیشبینی شده ژنهای کلیدی در ارتباط با بیوسنتز پروستاگلاندین، فاکتور هستهای کاپا B (NFKB)، پروتئین کیناز فعال شده با میتوژن (MAPK) و گیرنده گاما فعال شده با تکثیر پراکسیزوم (PPARG) بود. به نظر میرسد مسیرهای زیستی مربوط به این ژنها به ویژه ژنهای NFKB و MAPK میتوانند در جهت شناسایی نشانگرهای زیستی مرتبط با بیماری لکه سفید، تشخیص و یا طراحی مهارکننده علیه آن بیماری مفید باشند.
پسندیده, رضا و پسندیده, مجید . (1403). تحلیل بیوانفورماتیکی شبکه ژنی و مسیرهای زیستی مرتبط با بیماری لکه سفید (WSD) در میگوی سفید غربی (Litopenaeus vannamei). فیزیولوژی و بیوتکنولوژی آبزیان, (), -. doi: 10.22124/japb.2024.28614.1554
MLA
پسندیده, رضا , و پسندیده, مجید . "تحلیل بیوانفورماتیکی شبکه ژنی و مسیرهای زیستی مرتبط با بیماری لکه سفید (WSD) در میگوی سفید غربی (Litopenaeus vannamei)", فیزیولوژی و بیوتکنولوژی آبزیان, , , 1403, -. doi: 10.22124/japb.2024.28614.1554
HARVARD
پسندیده, رضا, پسندیده, مجید. (1403). 'تحلیل بیوانفورماتیکی شبکه ژنی و مسیرهای زیستی مرتبط با بیماری لکه سفید (WSD) در میگوی سفید غربی (Litopenaeus vannamei)', فیزیولوژی و بیوتکنولوژی آبزیان, (), pp. -. doi: 10.22124/japb.2024.28614.1554
CHICAGO
رضا پسندیده و مجید پسندیده, "تحلیل بیوانفورماتیکی شبکه ژنی و مسیرهای زیستی مرتبط با بیماری لکه سفید (WSD) در میگوی سفید غربی (Litopenaeus vannamei)," فیزیولوژی و بیوتکنولوژی آبزیان, (1403): -, doi: 10.22124/japb.2024.28614.1554
VANCOUVER
پسندیده, رضا, پسندیده, مجید. تحلیل بیوانفورماتیکی شبکه ژنی و مسیرهای زیستی مرتبط با بیماری لکه سفید (WSD) در میگوی سفید غربی (Litopenaeus vannamei). فیزیولوژی و بیوتکنولوژی آبزیان, 1403; (): -. doi: 10.22124/japb.2024.28614.1554